MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 43166

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011035	GAG	2	6	257	262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194097590
2	NC_011035	GTG	2	6	275	280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194097590
3	NC_011035	GCCG	2	8	362	369	0 %	0 %	50 %	50 %	194097590
4	NC_011035	GCGT	2	8	399	406	0 %	25 %	50 %	25 %	194097590
5	NC_011035	GGC	2	6	415	420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097590
6	NC_011035	GGA	2	6	469	474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194097590
7	NC_011035	AGG	2	6	486	491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194097590
8	NC_011035	CGG	3	9	546	554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097590
9	NC_011035	CGG	2	6	630	635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097590
10	NC_011035	CGGA	2	8	650	657	25 %	0 %	50 %	25 %	194097590
11	NC_011035	GAA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097590
12	NC_011035	AACC	2	8	694	701	50 %	0 %	0 %	50 %	194097590
13	NC_011035	GCG	2	6	755	760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097590
14	NC_011035	GCG	2	6	764	769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097590
15	NC_011035	TTC	2	6	809	814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194097590
16	NC_011035	GCA	2	6	822	827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097590
17	NC_011035	GAC	2	6	917	922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097590
18	NC_011035	CAA	2	6	952	957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097590
19	NC_011035	ACG	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097590
20	NC_011035	AGC	2	6	975	980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097590
21	NC_011035	CTG	2	6	998	1003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097590
22	NC_011035	CGA	2	6	1009	1014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097590
23	NC_011035	TCA	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097590
24	NC_011035	GAA	2	6	1049	1054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097590
25	NC_011035	A	6	6	1088	1093	100 %	0 %	0 %	0 %	194097590
26	NC_011035	GAC	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097590
27	NC_011035	GCC	2	6	1192	1197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097590
28	NC_011035	GCG	2	6	1241	1246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097590
29	NC_011035	GAGC	2	8	1338	1345	25 %	0 %	50 %	25 %	194097590
30	NC_011035	CCGTC	2	10	1360	1369	0 %	20 %	20 %	60 %	194097590
31	NC_011035	ATT	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194097590
32	NC_011035	TCA	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097590
33	NC_011035	CCG	2	6	1434	1439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097590
34	NC_011035	CAT	3	9	1441	1449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097590
35	NC_011035	A	6	6	1499	1504	100 %	0 %	0 %	0 %	194097590
36	NC_011035	TTCG	2	8	1591	1598	0 %	50 %	25 %	25 %	194097590
37	NC_011035	CTG	2	6	1691	1696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097590
38	NC_011035	TCG	2	6	1855	1860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097591
39	NC_011035	AC	3	6	1868	1873	50 %	0 %	0 %	50 %	194097591
40	NC_011035	GAGG	2	8	1971	1978	25 %	0 %	75 %	0 %	194097591
41	NC_011035	GC	4	8	2030	2037	0 %	0 %	50 %	50 %	194097591
42	NC_011035	TGCC	2	8	2038	2045	0 %	25 %	25 %	50 %	194097591
43	NC_011035	GAC	2	6	2070	2075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097591
44	NC_011035	CTGC	2	8	2124	2131	0 %	25 %	25 %	50 %	194097591
45	NC_011035	GAT	2	6	2144	2149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194097591
46	NC_011035	TAT	2	6	2253	2258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194097591
47	NC_011035	CTG	2	6	2268	2273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097591
48	NC_011035	CGAC	2	8	2308	2315	25 %	0 %	25 %	50 %	194097591
49	NC_011035	CG	3	6	2362	2367	0 %	0 %	50 %	50 %	194097591
50	NC_011035	AAC	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097591
51	NC_011035	CGA	2	6	2425	2430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097592
52	NC_011035	GCT	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097592
53	NC_011035	GC	3	6	2589	2594	0 %	0 %	50 %	50 %	194097592
54	NC_011035	GT	3	6	2601	2606	0 %	50 %	50 %	0 %	194097592
55	NC_011035	GC	4	8	2634	2641	0 %	0 %	50 %	50 %	194097592
56	NC_011035	CGT	2	6	2668	2673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097592
57	NC_011035	GCA	2	6	2676	2681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097592
58	NC_011035	GAA	2	6	2693	2698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097592
59	NC_011035	GC	3	6	2699	2704	0 %	0 %	50 %	50 %	194097592
60	NC_011035	GAA	2	6	2705	2710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097592
61	NC_011035	GCG	2	6	2730	2735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097592
62	NC_011035	CGA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097592
63	NC_011035	AT	3	6	2869	2874	50 %	50 %	0 %	0 %	194097592
64	NC_011035	CGG	2	6	3101	3106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
65	NC_011035	GCGCG	2	10	3107	3116	0 %	0 %	60 %	40 %	194097593
66	NC_011035	GCC	2	6	3123	3128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097593
67	NC_011035	T	6	6	3198	3203	0 %	100 %	0 %	0 %	194097593
68	NC_011035	GCG	2	6	3240	3245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
69	NC_011035	GAA	2	6	3246	3251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097593
70	NC_011035	GTC	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097593
71	NC_011035	GTT	2	6	3300	3305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194097593
72	NC_011035	CG	4	8	3320	3327	0 %	0 %	50 %	50 %	194097593
73	NC_011035	CTGC	2	8	3336	3343	0 %	25 %	25 %	50 %	194097593
74	NC_011035	CGA	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
75	NC_011035	GCC	2	6	3605	3610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097593
76	NC_011035	ATAA	2	8	3637	3644	75 %	25 %	0 %	0 %	194097593
77	NC_011035	CGG	2	6	3656	3661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
78	NC_011035	TCG	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097593
79	NC_011035	TGG	2	6	3718	3723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194097593
80	NC_011035	CGG	2	6	3772	3777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
81	NC_011035	ACG	2	6	3826	3831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
82	NC_011035	GCT	2	6	3851	3856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097593
83	NC_011035	GTT	2	6	3870	3875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194097593
84	NC_011035	CGA	3	9	3902	3910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
85	NC_011035	GCC	2	6	3934	3939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097593
86	NC_011035	TCA	2	6	3941	3946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097593
87	NC_011035	CGG	2	6	4007	4012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
88	NC_011035	CGG	3	9	4016	4024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
89	NC_011035	GTG	2	6	4068	4073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194097593
90	NC_011035	CAG	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
91	NC_011035	GCG	2	6	4151	4156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
92	NC_011035	CGCCGT	2	12	4319	4330	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194097593
93	NC_011035	GGC	2	6	4359	4364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
94	NC_011035	TCT	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194097593
95	NC_011035	CG	3	6	4409	4414	0 %	0 %	50 %	50 %	194097593
96	NC_011035	TGG	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194097593
97	NC_011035	GGA	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194097593
98	NC_011035	GAC	2	6	4486	4491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
99	NC_011035	CCG	2	6	4510	4515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097593
100	NC_011035	CA	3	6	4517	4522	50 %	0 %	0 %	50 %	194097593
101	NC_011035	AAC	2	6	4539	4544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097593
102	NC_011035	GCA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
103	NC_011035	T	6	6	4731	4736	0 %	100 %	0 %	0 %	194097593
104	NC_011035	GCG	3	9	4755	4763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
105	NC_011035	GTT	2	6	4806	4811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194097593
106	NC_011035	GC	3	6	4842	4847	0 %	0 %	50 %	50 %	194097593
107	NC_011035	A	6	6	4953	4958	100 %	0 %	0 %	0 %	194097593
108	NC_011035	GAC	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
109	NC_011035	CGG	2	6	5044	5049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
110	NC_011035	CAG	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
111	NC_011035	GTT	3	9	5121	5129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194097593
112	NC_011035	GCGG	2	8	5138	5145	0 %	0 %	75 %	25 %	194097593
113	NC_011035	GGC	2	6	5166	5171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
114	NC_011035	GGC	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
115	NC_011035	TGACG	2	10	5195	5204	20 %	20 %	40 %	20 %	194097593
116	NC_011035	AAT	2	6	5291	5296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194097594
117	NC_011035	ACGG	2	8	5362	5369	25 %	0 %	50 %	25 %	194097594
118	NC_011035	CGTT	2	8	5380	5387	0 %	50 %	25 %	25 %	194097594
119	NC_011035	GAAAA	2	10	5430	5439	80 %	0 %	20 %	0 %	194097594
120	NC_011035	CCT	2	6	5444	5449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194097594
121	NC_011035	CGC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097594
122	NC_011035	GTC	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097594
123	NC_011035	CGA	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097594
124	NC_011035	T	6	6	5607	5612	0 %	100 %	0 %	0 %	194097594
125	NC_011035	GTC	2	6	5668	5673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097594
126	NC_011035	GCAG	2	8	5675	5682	25 %	0 %	50 %	25 %	194097594
127	NC_011035	GGCGG	2	10	5702	5711	0 %	0 %	80 %	20 %	194097594
128	NC_011035	GAT	2	6	5763	5768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194097595
129	NC_011035	CGGCT	2	10	5775	5784	0 %	20 %	40 %	40 %	194097595
130	NC_011035	GCGG	2	8	5791	5798	0 %	0 %	75 %	25 %	194097595
131	NC_011035	GTA	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194097595
132	NC_011035	GTGGAA	2	12	5943	5954	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	194097595
133	NC_011035	TCG	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097595
134	NC_011035	GCGG	2	8	5999	6006	0 %	0 %	75 %	25 %	194097595
135	NC_011035	GTC	2	6	6024	6029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097595
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262	NC_011035	C	7	7	12163	12169	0 %	0 %	0 %	100 %	194097605
263	NC_011035	A	6	6	12182	12187	100 %	0 %	0 %	0 %	194097605
264	NC_011035	CCG	3	9	12269	12277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097605
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392	NC_011035	CCGC	2	8	20184	20191	0 %	0 %	25 %	75 %	194097621
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394	NC_011035	GAT	2	6	20219	20224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194097621
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